21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0903 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  215  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  89.32 
 
 
120 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  73.27 
 
 
101 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3362  hypothetical protein  74.26 
 
 
101 aa  140  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340425  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0794  hypothetical protein  60.27 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1650  Domain of unknown function DUF1905  43.55 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  39.29 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2973  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  37.5 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06800  protein of unknown function (DUF1905)  39.13 
 
 
179 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.430526  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  38.18 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  40.35 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  32.73 
 
 
199 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  32.73 
 
 
199 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  44.23 
 
 
163 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1217  hypothetical protein  36.36 
 
 
208 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  37.74 
 
 
205 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  32.31 
 
 
202 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03530  hypothetical protein  39.13 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>