19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1650 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1650  Domain of unknown function DUF1905  100 
 
 		 177 aa  352  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06800  protein of unknown function (DUF1905)  59.24 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.430526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  42.5 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2973  hypothetical protein  47.45 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03530  hypothetical protein  55 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  42.62 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  34.81 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  43.55 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  41.94 
 
 		 101 aa  57  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  28.87 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0794  hypothetical protein  47.69 
 
 		 79 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  32.26 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  39.68 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3362  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  34.78 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  39.34 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  23.94 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  23.94 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  20.92 
 
 		 159 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>