25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2973 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2973  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  373  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  60.23 
 
 		 177 aa  224  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1650  Domain of unknown function DUF1905  47.45 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06800  protein of unknown function (DUF1905)  40 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.430526  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03530  hypothetical protein  53.68 
 
 		 100 aa  89.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  32.84 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  44.59 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  24.26 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  39.19 
 
 		 104 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  24.5 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  35.19 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  34.02 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  40.98 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  34.65 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5932  hypothetical protein  34.72 
 
 		 97 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0433317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  26.39 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0070  hypothetical protein  24.16 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0794  hypothetical protein  37.66 
 
 		 79 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1686  hypothetical protein  43.1 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  36.51 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  36.51 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  31.91 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  29.47 
 
 		 151 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  25.95 
 
 		 148 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  36 
 
 		 148 aa  40.8  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>