27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0021 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2380  hypothetical protein  49.03 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.419898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  36.81 
 
 		 168 aa  94.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4564  hypothetical protein  35.66 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1938  hypothetical protein  32.41 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170885  normal  0.0315238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2906  hypothetical protein  29.68 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5574  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  36.07 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  28.66 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2238  Domain of unknown function DUF1905  41.56 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  35.42 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  32.91 
 
 		 199 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  27.72 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  33.68 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  30.53 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  32 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  31.76 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  33.87 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2490  hypothetical protein  27.63 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2729  hypothetical protein  27.63 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000111062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2716  hypothetical protein  27.63 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.635961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2530  hypothetical protein  27.63 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470515  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4086  Domain of unknown function DUF1905  49.02 
 
 		 95 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2568  hypothetical protein  26.97 
 
 		 217 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0115679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  35.94 
 
 		 206 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  35.29 
 
 		 210 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>