29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0258 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  100 
 
 		 148 aa  291  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  54.67 
 
 		 150 aa  173  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  59.86 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  39.86 
 
 		 151 aa  123  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  49.31 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  43.61 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4564  hypothetical protein  31.91 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  30.3 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1938  hypothetical protein  32.61 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170885  normal  0.0315238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  30.91 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0070  hypothetical protein  28.36 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1650  Domain of unknown function DUF1905  34.81 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1855  hypothetical protein  27.74 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.160181  hitchhiker  0.00411591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  29.66 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  35.42 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2380  hypothetical protein  31.86 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.419898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  43.86 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  42.11 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1487  hypothetical protein  25.76 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702863  normal  0.552132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3117  hypothetical protein  27.52 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  43.1 
 
 		 199 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  42.11 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  37.1 
 
 		 206 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  40.35 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  32.97 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  38.46 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0259051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  35.48 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>