57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5010 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4212  hypothetical protein  77.25 
 
 		 189 aa  314  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4100  hypothetical protein  77.25 
 
 		 189 aa  314  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0708804  normal  0.708257 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4043  hypothetical protein  73.54 
 
 		 189 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3478  hypothetical protein  73.54 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0383  hypothetical protein  66.49 
 
 		 196 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4664  hypothetical protein  56.22 
 
 		 196 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4256  hypothetical protein  52.69 
 
 		 192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0851  hypothetical protein  52.91 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3908  hypothetical protein  52.43 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31569  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  51.09 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2961  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1791  hypothetical protein  47.85 
 
 		 199 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.424253  hitchhiker  0.00317521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3065  hypothetical protein  50.54 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3959  hypothetical protein  54.05 
 
 		 194 aa  181  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3461  hypothetical protein  49.46 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5484  hypothetical protein  41.76 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265246  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2990  hypothetical protein  45.11 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0232  hypothetical protein  45.74 
 
 		 199 aa  161  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2746  hypothetical protein  46.49 
 
 		 206 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2639  hypothetical protein  45.16 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00506  conserved hypothetical protein  39.36 
 
 		 315 aa  152  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.848449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0604  hypothetical protein  46.2 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3304  hypothetical protein  42.49 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2209  hypothetical protein  41.67 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.92136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2061  hypothetical protein  44.86 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496679  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1715  hypothetical protein  44.63 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250535  normal  0.166877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0732  hypothetical protein  43.48 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4907  hypothetical protein  52.9 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0916  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12654  normal  0.0722419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0312  hypothetical protein  44.1 
 
 		 192 aa  141  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3017  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  37.7 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1383  hypothetical protein  41.85 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.0241422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  38.24 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  39.55 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0245  hypothetical protein  39.44 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00983479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14380  hypothetical protein  40.54 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.647802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4952  hypothetical protein  35.6 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0639865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1729  hypothetical protein  34.25 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136208  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4567  hypothetical protein  32.97 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1268  hypothetical protein  31.64 
 
 		 221 aa  95.1  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0402  hypothetical protein  33.53 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0412  hypothetical protein  33.53 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0259051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0836  hypothetical protein  36 
 
 		 137 aa  93.6  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2699  hypothetical protein  35.54 
 
 		 189 aa  92  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0854  hypothetical protein  30.65 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3034  hypothetical protein  39.71 
 
 		 126 aa  88.2  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1957  hypothetical protein  28.18 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5239  hypothetical protein  30.83 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0583  hypothetical protein  28.09 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1686  hypothetical protein  30.77 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3925  hypothetical protein  29 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0494  hypothetical protein  33.7 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.164199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  39.68 
 
 		 149 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  38.71 
 
 		 150 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  39.39 
 
 		 151 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>