18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1423 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  207  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  73.27 
 
 		 104 aa  160  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  72.28 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3362  hypothetical protein  73.27 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0794  hypothetical protein  65.75 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  46.77 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2973  hypothetical protein  45 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1650  Domain of unknown function DUF1905  41.94 
 
 		 177 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06800  protein of unknown function (DUF1905)  39.13 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.430526  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  49.12 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  37.5 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  43.4 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  42.11 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3478  hypothetical protein  31.34 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4043  hypothetical protein  31.34 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  31.75 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>