23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3068 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  366  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2973  hypothetical protein  60.23 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1650  Domain of unknown function DUF1905  42.5 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06800  protein of unknown function (DUF1905)  40 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.430526  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03530  hypothetical protein  56.7 
 
 		 100 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  28.17 
 
 		 150 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  46.77 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  28.66 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2380  hypothetical protein  30.66 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.419898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  23.23 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  26.76 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  29.66 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  41.94 
 
 		 120 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0794  hypothetical protein  47.69 
 
 		 79 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2906  hypothetical protein  25.68 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  35.59 
 
 		 197 aa  44.3  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  32.5 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  36.36 
 
 		 205 aa  41.6  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0070  hypothetical protein  23.97 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1844  LAAC  33.87 
 
 		 217 aa  41.2  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.107675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>