16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3091 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  250  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  89.32 
 
 
104 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  72.28 
 
 
101 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3362  hypothetical protein  75.25 
 
 
101 aa  144  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340425  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0794  hypothetical protein  61.64 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1650  Domain of unknown function DUF1905  42.62 
 
 
177 aa  53.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  41.94 
 
 
177 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  39.29 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  42.11 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2973  hypothetical protein  44.68 
 
 
183 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06800  protein of unknown function (DUF1905)  36.96 
 
 
179 aa  42.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.430526  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  37.5 
 
 
199 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  44.23 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03530  hypothetical protein  39.13 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  36.84 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>