43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6953 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  54.67 
 
 		 148 aa  173  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  53.69 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  46.26 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  43.06 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  40.15 
 
 		 148 aa  95.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4564  hypothetical protein  34.75 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  33.08 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1938  hypothetical protein  33.59 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170885  normal  0.0315238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  33.11 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  28.17 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  38.81 
 
 		 205 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2973  hypothetical protein  32.84 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1855  hypothetical protein  25 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.160181  hitchhiker  0.00411591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  43.28 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2380  hypothetical protein  33.61 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.419898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1791  hypothetical protein  45.31 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.424253  hitchhiker  0.00317521 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0088  hypothetical protein  28.12 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3117  hypothetical protein  26 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2113  hypothetical protein  26.92 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  38.71 
 
 		 210 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  41.67 
 
 		 199 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1650  Domain of unknown function DUF1905  28.87 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4100  hypothetical protein  41.38 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0708804  normal  0.708257 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4212  hypothetical protein  41.38 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0851  hypothetical protein  42.86 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  30.53 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3908  hypothetical protein  35.16 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31569  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  37.74 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3017  hypothetical protein  40.35 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4256  hypothetical protein  33.87 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4043  hypothetical protein  36.36 
 
 		 189 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3478  hypothetical protein  36.36 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1729  hypothetical protein  41.18 
 
 		 193 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136208  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  32.81 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2209  hypothetical protein  38.6 
 
 		 190 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.92136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0383  hypothetical protein  36.36 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  34.38 
 
 		 190 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5932  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0433317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  36.84 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2961  hypothetical protein  36.51 
 
 		 219 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  31.67 
 
 		 193 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>