55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4256 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4256  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  52.69 
 
 		 210 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0851  hypothetical protein  51.05 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  52.72 
 
 		 204 aa  206  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4100  hypothetical protein  51.35 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0708804  normal  0.708257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3908  hypothetical protein  50.82 
 
 		 194 aa  203  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31569  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4212  hypothetical protein  51.35 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4043  hypothetical protein  51.34 
 
 		 189 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3478  hypothetical protein  51.34 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4664  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0383  hypothetical protein  48.91 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1791  hypothetical protein  47.25 
 
 		 199 aa  184  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.424253  hitchhiker  0.00317521 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00506  conserved hypothetical protein  44.04 
 
 		 315 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.848449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2961  hypothetical protein  43.41 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0312  hypothetical protein  43.2 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5484  hypothetical protein  43.62 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265246  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2209  hypothetical protein  44.74 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.92136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3065  hypothetical protein  44.51 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2746  hypothetical protein  44.94 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3017  hypothetical protein  43.68 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2990  hypothetical protein  42.29 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3959  hypothetical protein  42.16 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0916  hypothetical protein  55.07 
 
 		 173 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12654  normal  0.0722419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2061  hypothetical protein  44.94 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496679  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0232  hypothetical protein  39.67 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0732  hypothetical protein  42.86 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2639  hypothetical protein  40.53 
 
 		 207 aa  144  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3304  hypothetical protein  40.66 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0245  hypothetical protein  44.57 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00983479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14380  hypothetical protein  42.63 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.647802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1715  hypothetical protein  41.81 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250535  normal  0.166877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3461  hypothetical protein  39.56 
 
 		 199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  38.41 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4907  hypothetical protein  39.38 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1729  hypothetical protein  38.55 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136208  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1383  hypothetical protein  38.2 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.0241422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  38.69 
 
 		 194 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0604  hypothetical protein  39.33 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4952  hypothetical protein  35.03 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0639865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  32.6 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2699  hypothetical protein  36.97 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0836  hypothetical protein  44.83 
 
 		 137 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1268  hypothetical protein  30.69 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0402  hypothetical protein  33.15 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0412  hypothetical protein  33.15 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0259051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1957  hypothetical protein  32.07 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4567  hypothetical protein  31.55 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0854  hypothetical protein  31.28 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1686  hypothetical protein  27.87 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3925  hypothetical protein  31.75 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3034  hypothetical protein  36.67 
 
 		 126 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0494  hypothetical protein  27.13 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.164199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0583  hypothetical protein  31.3 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5239  hypothetical protein  29.09 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  33.87 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>