54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3304 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3304  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2639  hypothetical protein  61.7 
 
 
207 aa  224  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2990  hypothetical protein  54.69 
 
 
200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  50.8 
 
 
204 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4043  hypothetical protein  51.35 
 
 
189 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0383  hypothetical protein  49.73 
 
 
196 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0232  hypothetical protein  55.03 
 
 
199 aa  178  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3478  hypothetical protein  51.35 
 
 
212 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0732  hypothetical protein  52.08 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0851  hypothetical protein  52.51 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2746  hypothetical protein  50.52 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3908  hypothetical protein  48.92 
 
 
194 aa  168  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31569  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4664  hypothetical protein  49.44 
 
 
196 aa  164  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0604  hypothetical protein  51.58 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1791  hypothetical protein  47.59 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.424253  hitchhiker  0.00317521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2061  hypothetical protein  48.96 
 
 
200 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496679  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4212  hypothetical protein  43.78 
 
 
189 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4100  hypothetical protein  43.78 
 
 
189 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0708804  normal  0.708257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  42.49 
 
 
210 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1383  hypothetical protein  48.44 
 
 
206 aa  154  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.0241422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4256  hypothetical protein  40.66 
 
 
192 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5484  hypothetical protein  43.65 
 
 
202 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265246  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2961  hypothetical protein  45.7 
 
 
219 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3065  hypothetical protein  47.85 
 
 
219 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3959  hypothetical protein  49.73 
 
 
194 aa  136  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3461  hypothetical protein  45.88 
 
 
199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30578  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0312  hypothetical protein  46.34 
 
 
192 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00506  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 
315 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.848449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4907  hypothetical protein  45.95 
 
 
184 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0916  hypothetical protein  53.54 
 
 
173 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12654  normal  0.0722419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2209  hypothetical protein  38.37 
 
 
190 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.92136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1715  hypothetical protein  45.16 
 
 
183 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250535  normal  0.166877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3017  hypothetical protein  38.37 
 
 
191 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0245  hypothetical protein  43.72 
 
 
187 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00983479  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  36.99 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  36.41 
 
 
197 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14380  hypothetical protein  44.79 
 
 
190 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.647802  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  32.43 
 
 
194 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1268  hypothetical protein  33.99 
 
 
221 aa  104  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0402  hypothetical protein  31.22 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0412  hypothetical protein  31.22 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0259051  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4952  hypothetical protein  34.25 
 
 
198 aa  97.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0639865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1729  hypothetical protein  32.58 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136208  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4567  hypothetical protein  35.52 
 
 
190 aa  94  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1686  hypothetical protein  36.76 
 
 
186 aa  91.7  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0854  hypothetical protein  29.55 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0836  hypothetical protein  35.56 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2699  hypothetical protein  31.93 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115069  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3034  hypothetical protein  35.9 
 
 
126 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0583  hypothetical protein  41 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1957  hypothetical protein  35.56 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3925  hypothetical protein  38.83 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5239  hypothetical protein  35 
 
 
189 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0494  hypothetical protein  32.61 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.164199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>