57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4567 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4567  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4952  hypothetical protein  43.33 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0639865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  39.31 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  39.88 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0402  hypothetical protein  36.52 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0412  hypothetical protein  36.52 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0259051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  39.88 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1729  hypothetical protein  37.14 
 
 		 193 aa  127  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136208  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  35.87 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1268  hypothetical protein  35.56 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2961  hypothetical protein  38.64 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4664  hypothetical protein  34.95 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0851  hypothetical protein  38.37 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3065  hypothetical protein  38.64 
 
 		 219 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1686  hypothetical protein  37.57 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0383  hypothetical protein  34.07 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0732  hypothetical protein  38.8 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3908  hypothetical protein  35.26 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31569  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  32.97 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4043  hypothetical protein  35.26 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2990  hypothetical protein  39.08 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2209  hypothetical protein  32.29 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.92136  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0836  hypothetical protein  37.4 
 
 		 137 aa  100  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5484  hypothetical protein  31.15 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265246  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4212  hypothetical protein  32.57 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0604  hypothetical protein  38.33 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4100  hypothetical protein  32.57 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0708804  normal  0.708257 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3478  hypothetical protein  34.68 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4256  hypothetical protein  31.55 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0312  hypothetical protein  37.87 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0232  hypothetical protein  40.45 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3017  hypothetical protein  31.4 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2061  hypothetical protein  35 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496679  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2746  hypothetical protein  36.17 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2639  hypothetical protein  39.25 
 
 		 207 aa  90.9  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0916  hypothetical protein  33.97 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12654  normal  0.0722419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1383  hypothetical protein  38.64 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.0241422 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2699  hypothetical protein  31.03 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3034  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  85.1  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0854  hypothetical protein  27.01 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3304  hypothetical protein  41.96 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0245  hypothetical protein  35 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00983479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3925  hypothetical protein  34.83 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14380  hypothetical protein  33.7 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.647802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1957  hypothetical protein  31.93 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1791  hypothetical protein  33.14 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.424253  hitchhiker  0.00317521 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3959  hypothetical protein  31.55 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0583  hypothetical protein  29.05 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00506  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.848449 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0494  hypothetical protein  27.59 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.164199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1715  hypothetical protein  30.86 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250535  normal  0.166877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3461  hypothetical protein  34.07 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4907  hypothetical protein  31.86 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5239  hypothetical protein  26.11 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  48.33 
 
 		 148 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  46.43 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  41.2  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>