56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0732 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0732  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0604  hypothetical protein  81.63 
 
 
198 aa  298  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2990  hypothetical protein  70.56 
 
 
200 aa  262  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0232  hypothetical protein  66.33 
 
 
199 aa  244  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2746  hypothetical protein  67 
 
 
206 aa  244  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2061  hypothetical protein  67 
 
 
200 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496679  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1383  hypothetical protein  64.47 
 
 
206 aa  220  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.0241422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2639  hypothetical protein  56.02 
 
 
207 aa  192  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  46.2 
 
 
204 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3304  hypothetical protein  52.08 
 
 
209 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4664  hypothetical protein  49.44 
 
 
196 aa  167  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3908  hypothetical protein  47.46 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31569  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0383  hypothetical protein  45.65 
 
 
196 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4256  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  158  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0851  hypothetical protein  45.65 
 
 
207 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2961  hypothetical protein  44.67 
 
 
219 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4212  hypothetical protein  41.08 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  43.48 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4100  hypothetical protein  41.08 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0708804  normal  0.708257 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4043  hypothetical protein  42.93 
 
 
189 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3478  hypothetical protein  42.93 
 
 
212 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3065  hypothetical protein  46.88 
 
 
219 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0312  hypothetical protein  51.3 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3461  hypothetical protein  48.09 
 
 
199 aa  138  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30578  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1791  hypothetical protein  40.1 
 
 
199 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.424253  hitchhiker  0.00317521 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3959  hypothetical protein  49.44 
 
 
194 aa  135  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5484  hypothetical protein  42.39 
 
 
202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265246  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2209  hypothetical protein  38.01 
 
 
190 aa  134  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.92136  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00506  conserved hypothetical protein  36.08 
 
 
315 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.848449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3017  hypothetical protein  38.01 
 
 
191 aa  127  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4952  hypothetical protein  39.66 
 
 
198 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0639865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1715  hypothetical protein  43.02 
 
 
183 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250535  normal  0.166877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1729  hypothetical protein  35.94 
 
 
193 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136208  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14380  hypothetical protein  46.3 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.647802  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4567  hypothetical protein  38.8 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4907  hypothetical protein  48.1 
 
 
184 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1268  hypothetical protein  38.73 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0916  hypothetical protein  47.24 
 
 
173 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12654  normal  0.0722419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  34.64 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  32.79 
 
 
197 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  32.8 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0245  hypothetical protein  39.04 
 
 
187 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00983479  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0836  hypothetical protein  35.07 
 
 
137 aa  98.6  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2699  hypothetical protein  37.58 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115069  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0412  hypothetical protein  28.73 
 
 
196 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0259051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0402  hypothetical protein  28.73 
 
 
196 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1686  hypothetical protein  34.62 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3925  hypothetical protein  48.96 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1957  hypothetical protein  28.8 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3034  hypothetical protein  41.28 
 
 
126 aa  79  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0854  hypothetical protein  30.06 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0494  hypothetical protein  36.89 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.164199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5239  hypothetical protein  34.62 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0583  hypothetical protein  31.88 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  45 
 
 
148 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  44.07 
 
 
177 aa  45.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0120181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>