55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3065 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3065  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2961  hypothetical protein  91.28 
 
 
219 aa  400  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0851  hypothetical protein  57.53 
 
 
207 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4664  hypothetical protein  55.61 
 
 
196 aa  204  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4043  hypothetical protein  52.66 
 
 
189 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3478  hypothetical protein  52.13 
 
 
212 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0383  hypothetical protein  50.26 
 
 
196 aa  201  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4212  hypothetical protein  50.8 
 
 
189 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4100  hypothetical protein  50.8 
 
 
189 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0708804  normal  0.708257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  50.54 
 
 
210 aa  197  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  46.74 
 
 
204 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3908  hypothetical protein  50.81 
 
 
194 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31569  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4256  hypothetical protein  44.51 
 
 
192 aa  178  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0232  hypothetical protein  54.45 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5484  hypothetical protein  41.71 
 
 
202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265246  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0916  hypothetical protein  58.82 
 
 
173 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12654  normal  0.0722419 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3959  hypothetical protein  51.89 
 
 
194 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2990  hypothetical protein  50 
 
 
200 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3461  hypothetical protein  50.77 
 
 
199 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30578  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2639  hypothetical protein  50.53 
 
 
207 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0732  hypothetical protein  46.88 
 
 
202 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0312  hypothetical protein  46.71 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2209  hypothetical protein  42.01 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.92136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0604  hypothetical protein  47.85 
 
 
198 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3017  hypothetical protein  42.01 
 
 
191 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00506  conserved hypothetical protein  38.68 
 
 
315 aa  140  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.848449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1791  hypothetical protein  41.4 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.424253  hitchhiker  0.00317521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3304  hypothetical protein  47.85 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1715  hypothetical protein  45.88 
 
 
183 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250535  normal  0.166877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2061  hypothetical protein  45.5 
 
 
200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496679  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2746  hypothetical protein  43.09 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1383  hypothetical protein  44.94 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.0241422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14380  hypothetical protein  43.02 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.647802  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4952  hypothetical protein  37.28 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0639865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  34.3 
 
 
193 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  35.91 
 
 
197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4907  hypothetical protein  49.02 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4567  hypothetical protein  38.64 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  35.03 
 
 
194 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1729  hypothetical protein  33.54 
 
 
193 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136208  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0245  hypothetical protein  39.55 
 
 
187 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00983479  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1268  hypothetical protein  34.71 
 
 
221 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0412  hypothetical protein  33.54 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0259051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0402  hypothetical protein  33.54 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0836  hypothetical protein  32.77 
 
 
137 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2699  hypothetical protein  29.65 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115069  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0854  hypothetical protein  25.9 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1686  hypothetical protein  35.09 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3034  hypothetical protein  37.7 
 
 
126 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3925  hypothetical protein  35.48 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1957  hypothetical protein  26.79 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5239  hypothetical protein  28.43 
 
 
189 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  52.38 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0583  hypothetical protein  34.09 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0494  hypothetical protein  29.55 
 
 
191 aa  49.3  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.164199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>