58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3461 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3461  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  394  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30578  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1791  hypothetical protein  55.15 
 
 
199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.424253  hitchhiker  0.00317521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0383  hypothetical protein  50.54 
 
 
196 aa  202  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3908  hypothetical protein  49.48 
 
 
194 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31569  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4043  hypothetical protein  52.17 
 
 
189 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3478  hypothetical protein  52.72 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3959  hypothetical protein  59.07 
 
 
194 aa  197  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  49.46 
 
 
210 aa  194  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  49.22 
 
 
204 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4100  hypothetical protein  47.85 
 
 
189 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0708804  normal  0.708257 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4212  hypothetical protein  47.85 
 
 
189 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4664  hypothetical protein  53.8 
 
 
196 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0851  hypothetical protein  52.69 
 
 
207 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2961  hypothetical protein  51.61 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3065  hypothetical protein  50.77 
 
 
219 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2990  hypothetical protein  50.79 
 
 
200 aa  164  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0232  hypothetical protein  52.88 
 
 
199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4256  hypothetical protein  39.56 
 
 
192 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5484  hypothetical protein  44.21 
 
 
202 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265246  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2746  hypothetical protein  50.57 
 
 
206 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2061  hypothetical protein  51.12 
 
 
200 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496679  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1383  hypothetical protein  50 
 
 
206 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.0241422 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00506  conserved hypothetical protein  41.71 
 
 
315 aa  150  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.848449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2639  hypothetical protein  47.42 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0732  hypothetical protein  48.09 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3304  hypothetical protein  46.91 
 
 
209 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0604  hypothetical protein  47.64 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4907  hypothetical protein  55.84 
 
 
184 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2209  hypothetical protein  38.8 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.92136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3017  hypothetical protein  38.8 
 
 
191 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0312  hypothetical protein  44.44 
 
 
192 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0245  hypothetical protein  46.41 
 
 
187 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00983479  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1715  hypothetical protein  43.02 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250535  normal  0.166877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14380  hypothetical protein  45.41 
 
 
190 aa  124  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.647802  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0916  hypothetical protein  48.94 
 
 
173 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12654  normal  0.0722419 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  37.04 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4952  hypothetical protein  36.02 
 
 
198 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0639865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4567  hypothetical protein  34.07 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1268  hypothetical protein  33.89 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1686  hypothetical protein  37.65 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3034  hypothetical protein  43.52 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1729  hypothetical protein  27.37 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136208  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0854  hypothetical protein  29.28 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1957  hypothetical protein  28.11 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0402  hypothetical protein  24.58 
 
 
196 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0412  hypothetical protein  24.58 
 
 
196 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0259051  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3925  hypothetical protein  39.84 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2699  hypothetical protein  30.91 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115069  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0836  hypothetical protein  31.15 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259741 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0583  hypothetical protein  29.91 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  31.68 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  32.79 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  46.43 
 
 
101 aa  42  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  43.1 
 
 
149 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  40.68 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  36.21 
 
 
151 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>