15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1938 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1938  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  352  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170885  normal  0.0315238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4564  hypothetical protein  49.1 
 
 		 171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  45.51 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2906  hypothetical protein  40.36 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  32.41 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.419898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  33.59 
 
 		 150 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  32.61 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  28.1 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5932  hypothetical protein  31.51 
 
 		 97 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0433317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  27.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2113  hypothetical protein  28.26 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4946  hypothetical protein  32.95 
 
 		 97 aa  44.3  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  26.72 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1487  hypothetical protein  27.35 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702863  normal  0.552132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>