15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1487 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1487  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  329  9e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702863  normal  0.552132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2113  hypothetical protein  58.97 
 
 
160 aa  197  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25206  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1855  hypothetical protein  51.92 
 
 
160 aa  166  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.160181  hitchhiker  0.00411591 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0088  hypothetical protein  51.57 
 
 
162 aa  158  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  30.2 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  28.12 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  25.76 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  30.84 
 
 
206 aa  47.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  24.11 
 
 
163 aa  47.4  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0070  hypothetical protein  29.55 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  33.93 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  27.4 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  37.29 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1938  hypothetical protein  27.35 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170885  normal  0.0315238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  27.54 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>