14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03530 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03530  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  197  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  57.73 
 
 
177 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2973  hypothetical protein  54.74 
 
 
183 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1650  Domain of unknown function DUF1905  55 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06800  protein of unknown function (DUF1905)  39.76 
 
 
179 aa  52.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.430526  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  40.32 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  38.46 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  39.34 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  39.71 
 
 
190 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  29.33 
 
 
206 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  32.1 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0794  hypothetical protein  46.88 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  36.36 
 
 
199 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  34.62 
 
 
148 aa  42  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>