14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2238 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2238  Domain of unknown function DUF1905  100 
 
 
105 aa  212  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4086  Domain of unknown function DUF1905  66.29 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4946  hypothetical protein  49.43 
 
 
97 aa  84  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5932  hypothetical protein  41.35 
 
 
97 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0433317  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03330  protein of unknown function (DUF1905)  41.76 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2380  hypothetical protein  46.25 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.419898  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  41.56 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5574  hypothetical protein  34.62 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  38.57 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0164  hypothetical protein  30.38 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2321  Domain of unknown function DUF1905  30.49 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  33.85 
 
 
177 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2973  hypothetical protein  32.94 
 
 
183 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>