More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3408 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3408  histidine kinase  100 
 
 
158 aa  324  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3494  histidine kinase  61.18 
 
 
157 aa  192  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1767  histidine kinase  61.94 
 
 
140 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  37.09 
 
 
469 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
471 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
399 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  27.41 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  35.37 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
414 aa  70.9  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1530  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00284281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  40.66 
 
 
643 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  38.46 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  34.06 
 
 
464 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0486  putative signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  32.39 
 
 
459 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
485 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  34 
 
 
485 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  33.56 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
469 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
640 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  29.93 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  34.03 
 
 
640 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
401 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  39.08 
 
 
653 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  32.12 
 
 
249 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
421 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  41.58 
 
 
373 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  29.87 
 
 
515 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4531  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
516 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051954 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  31.13 
 
 
461 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
401 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
401 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  39.78 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
398 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  38.95 
 
 
384 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
373 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
508 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
391 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
464 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
484 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
373 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
385 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  33.33 
 
 
460 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
658 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
352 aa  65.1  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
552 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  35 
 
 
451 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  29.59 
 
 
413 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
408 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
480 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
480 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
403 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
662 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  29.88 
 
 
470 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  31.91 
 
 
447 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  34.62 
 
 
1033 aa  64.3  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
391 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  30.14 
 
 
662 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  25 
 
 
392 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
447 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
661 aa  64.3  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  29.58 
 
 
457 aa  64.3  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  27.97 
 
 
351 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  27.97 
 
 
351 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  29.93 
 
 
347 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 
1648 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
471 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  32.06 
 
 
497 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  35.29 
 
 
456 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  28.68 
 
 
344 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  37.63 
 
 
363 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  28.68 
 
 
344 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
332 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  40.22 
 
 
1031 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
682 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  31.91 
 
 
518 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
453 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1114  histidine kinase  32.41 
 
 
444 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0404541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  25.17 
 
 
381 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  32.12 
 
 
397 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
346 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  28.57 
 
 
395 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
446 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  36.9 
 
 
470 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30.94 
 
 
466 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
466 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.96 
 
 
387 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  36.67 
 
 
430 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  30.94 
 
 
466 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  30.94 
 
 
466 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
451 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
501 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1869  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
553 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
459 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  31.31 
 
 
309 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 
370 aa  62  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>