5137 genes were found for organism Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Fjoh_0001  CDS  NC_009441  96  1145  +  1050  riboflavin biosynthesis protein RibD  YP_001192358  normal  0.279775  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0002  CDS  NC_009441  1138  1740  +  603  HAD family hydrolase  YP_001192359  normal  0.142779  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0003  CDS  NC_009441  1918  2550  +  633  hypothetical protein  YP_001192360  normal  0.606692  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0004  CDS  NC_009441  2582  2986  -  405  thioesterase superfamily protein  YP_001192361  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0005  CDS  NC_009441  3174  4601  +  1428  chromosomal replication initiation protein  YP_001192362  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0006  CDS  NC_009441  4610  5077  +  468  protein tyrosine phosphatase  YP_001192363  normal  0.811776  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0007  CDS  NC_009441  5133  5846  +  714  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  YP_001192364  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0008  CDS  NC_009441  5860  6378  +  519  hypothetical protein  YP_001192365  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0009  CDS  NC_009441  6362  7489  +  1128  aminotransferase, class I and II  YP_001192366  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0010  CDS  NC_009441  7564  8445  +  882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001192367  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0011  CDS  NC_009441  8709  9317  +  609  uridine kinase  YP_001192368  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0012  CDS  NC_009441  9424  9756  +  333  septum formation initiator  YP_001192369  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0013  CDS  NC_009441  9774  11135  +  1362  methylmalonyl-CoA mutase  YP_001192370  normal  0.431519  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0014  CDS  NC_009441  11178  13313  +  2136  methylmalonyl-CoA mutase  YP_001192371  normal  0.185174  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0015  CDS  NC_009441  13364  14008  -  645  hypothetical protein  YP_001192372  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0016  CDS  NC_009441  14542  15576  -  1035  aminodeoxychorismate lyase  YP_001192373  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0017  CDS  NC_009441  15587  16120  -  534  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001192374  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0018  CDS  NC_009441  16177  16959  -  783  diaminopimelate epimerase  YP_001192375  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0019  CDS  NC_009441  17134  18534  +  1401  protease Do  YP_001192376  normal  0.822523  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0020  CDS  NC_009441  18745  20193  +  1449  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  YP_001192377  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0021  CDS  NC_009441  20255  20713  -  459  AsnC family transcriptional regulator  YP_001192378  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0022  CDS  NC_009441  20915  22033  +  1119  alanine dehydrogenase  YP_001192379  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0023  CDS  NC_009441  22159  23778  -  1620  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  YP_001192380  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0024  CDS  NC_009441  30377  32323  +  1947  threonyl-tRNA synthetase  YP_001192381  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0025  CDS  NC_009441  32505  32894  +  390  initiation factor 3  YP_001192382  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0026  CDS  NC_009441  32999  33196  +  198  50S ribosomal protein L35  YP_001192383  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0027  CDS  NC_009441  33382  33726  +  345  50S ribosomal protein L20  YP_001192384  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0028  CDS  NC_009441  33849  34421  +  573  cyclic nucleotide-binding protein  YP_001192385  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0029  CDS  NC_009441  34500  34934  +  435  alkylhydroperoxidase  YP_001192386  normal  0.622456  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0030  CDS  NC_009441  35107  36825  +  1719  putative signal transduction histidine kinase  YP_001192387  normal  0.11045  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0031  CDS  NC_009441  36826  38595  +  1770  putative signal transduction histidine kinase  YP_001192388  normal  0.0655535  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0032  CDS  NC_009441  38597  40375  +  1779  TPR repeat-containing protein  YP_001192389  decreased coverage  0.00127267  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0033  CDS  NC_009441  40386  41054  +  669  response regulator receiver protein  YP_001192390  normal  0.0308763  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0034  CDS  NC_009441  41418  42227  +  810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_001192391  normal  0.0892428  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0035  CDS  NC_009441  42230  43489  -  1260  hypothetical protein  YP_001192392  normal  0.0446947  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0036  CDS  NC_009441  43829  44494  -  666  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_001192393  normal  0.0464925  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0037  CDS  NC_009441  44594  44689  -  96  hypothetical protein  YP_001192394  normal  0.0904024  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0038  CDS  NC_009441  44795  45385  -  591  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  YP_001192395  normal  0.238676  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0039  CDS  NC_009441  45393  46043  -  651  hypothetical protein  YP_001192396  normal  0.124626  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0040  CDS  NC_009441  46070  46429  -  360  hypothetical protein  YP_001192397  normal  0.0445644  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0041  CDS  NC_009441  46609  48153  -  1545  replicative DNA helicase  YP_001192398  normal  0.152715  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0042  CDS  NC_009441  48295  49248  -  954  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha  YP_001192399  normal  0.079598  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0043  CDS  NC_009441  49361  50251  -  891  hypothetical protein  YP_001192400  normal  0.355426  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0044  CDS  NC_009441  50238  51326  -  1089  permease YjgP/YjgQ family protein  YP_001192401  normal  0.484166  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0045  CDS  NC_009441  51394  52524  -  1131  queuine tRNA-ribosyltransferase  YP_001192402  normal  0.642849  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0046  CDS  NC_009441  52684  53607  +  924  YdjC family protein  YP_001192403  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0047  CDS  NC_009441  53710  54012  +  303  hypothetical protein  YP_001192404  normal  0.97796  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0048  CDS  NC_009441  54263  55111  +  849  transketolase domain-containing protein  YP_001192405  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0049  CDS  NC_009441  55185  56138  +  954  transketolase, central region  YP_001192406  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0050  CDS  NC_009441  56332  57498  -  1167  hypothetical protein  YP_001192407  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0051  CDS  NC_009441  57578  57973  +  396  RNA-binding S4 domain-containing protein  YP_001192408  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0052  CDS  NC_009441  58048  58548  +  501  phosphoribosyltransferase  YP_001192409  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0053  CDS  NC_009441  58540  59058  -  519  shikimate kinase  YP_001192410  normal  0.541651  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0054  CDS  NC_009441  59754  60158  +  405  hypothetical protein  YP_001192411  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0055  CDS  NC_009441  60603  61103  +  501  TPR repeat-containing protein  YP_001192412  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0056  CDS  NC_009441  61310  62209  +  900  MerR family transcriptional regulator  YP_001192413  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0057  CDS  NC_009441  62247  63713  +  1467  phytoene dehydrogenase-related protein  YP_001192414  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0058  CDS  NC_009441  63718  64557  +  840  squalene/phytoene synthase  YP_001192415  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0059  CDS  NC_009441  64793  65233  +  441  carotene hydroxylase  YP_001192416  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0060  CDS  NC_009441  65265  65774  +  510  hypothetical protein  YP_001192417  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0061  CDS  NC_009441  65967  67262  +  1296  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  YP_001192418  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0062  CDS  NC_009441  67426  68730  -  1305  hypothetical protein  YP_001192419  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0063  CDS  NC_009441  68727  69389  -  663  hypothetical protein  YP_001192420  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0064  CDS  NC_009441  69488  70399  +  912  hypothetical protein  YP_001192421  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0065  CDS  NC_009441  70404  70976  -  573  hypothetical protein  YP_001192422  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0066  CDS  NC_009441  71319  71714  -  396  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001192423  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0067  CDS  NC_009441  71758  72306  -  549  thioesterase superfamily protein  YP_001192424  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0068  CDS  NC_009441  72495  73868  -  1374  hypothetical protein  YP_001192425  normal  0.243757  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0069  CDS  NC_009441  74067  74915  +  849  hypothetical protein  YP_001192426  normal  0.407195  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0070  CDS  NC_009441  74923  75321  +  399  hypothetical protein  YP_001192427  normal  0.381782  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0071  CDS  NC_009441  75409  75924  +  516  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001192428  normal  0.826605  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0072  CDS  NC_009441  75921  77897  +  1977  hypothetical protein  YP_001192429  normal  0.447332  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0073  CDS  NC_009441  77940  78467  +  528  hypothetical protein  YP_001192430  normal  0.237178  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0074  CDS  NC_009441  78528  81929  -  3402  endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_001192431  normal  0.659099  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0075  CDS  NC_009441  82241  82993  -  753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001192432  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0076  CDS  NC_009441  83145  83615  -  471  hypothetical protein  YP_001192433  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0077  CDS  NC_009441  83941  84513  +  573  pseudouridine synthase  YP_001192434  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0078  CDS  NC_009441  84535  84990  +  456  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  YP_001192435  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0079  CDS  NC_009441  85025  85831  +  807  hypothetical protein  YP_001192436  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0080  CDS  NC_009441  85828  86604  -  777  ABC transporter related  YP_001192437  normal  0.871899  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0081  CDS  NC_009441  86696  87109  -  414  hypothetical protein  YP_001192438  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0082  CDS  NC_009441  87184  88152  -  969  transport system permease protein  YP_001192439  normal  0.85435  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0083  CDS  NC_009441  88214  89356  -  1143  periplasmic binding protein  YP_001192440  normal  0.622653  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0084  CDS  NC_009441  89452  89814  +  363  hypothetical protein  YP_001192441  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0085  CDS  NC_009441  89845  90222  +  378  hypothetical protein  YP_001192442  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0086  CDS  NC_009441  90253  90762  +  510  cobalbumin biosynthesis enzyme  YP_001192443  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0087  CDS  NC_009441  90927  92606  +  1680  nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  YP_001192444  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0088  CDS  NC_009441  92674  93105  +  432  hypothetical protein  YP_001192445  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0089  CDS  NC_009441  93316  94101  +  786  cobalamin 5'-phosphate synthase  YP_001192446  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0090  CDS  NC_009441  94086  94619  +  534  phosphoglycerate mutase  YP_001192447  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0091  CDS  NC_009441  94955  96778  +  1824  TonB-dependent receptor  YP_001192448  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0092  CDS  NC_009441  96784  97851  +  1068  hypothetical protein  YP_001192449  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0093  CDS  NC_009441  97909  99381  -  1473  peptidase S41  YP_001192450  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0094  CDS  NC_009441  99532  100041  +  510  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001192451  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0095  CDS  NC_009441  100028  100483  +  456  hypothetical protein  YP_001192452  normal  0.734712  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0096  CDS  NC_009441  100500  101027  +  528  hypothetical protein  YP_001192453  normal  0.566945  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0097  CDS  NC_009441  101030  101569  +  540  hypothetical protein  YP_001192454  normal  0.651822  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0098  CDS  NC_009441  101720  102118  +  399  YiaAB two helix domain-containing protein  YP_001192455  normal  0.365723  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0099  CDS  NC_009441  102192  105047  -  2856  carbamoyl phosphate synthase large subunit  YP_001192456  normal  0.217171  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Fjoh_0100  CDS  NC_009441  105192  105353  -  162  50S ribosomal protein L34  YP_001192457  normal  1  n/a    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>