34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0092 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0092  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12503  putative surface layer protein  42.59 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4099  hypothetical protein  30.69 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5794  hypothetical protein  28.49 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0956926 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1609  surface layer protein  28.02 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0932034  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1919  hypothetical protein  27.97 
 
 		 374 aa  89.7  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.268267  normal  0.285057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1874  hypothetical protein  27.75 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3942  hypothetical protein  27.78 
 
 		 383 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.437701  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2674  hypothetical protein  27.71 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.05 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.86 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.43 
 
 		 752 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  32.45 
 
 		 819 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.85 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  31.91 
 
 		 391 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.31 
 
 		 689 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.96 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.7 
 
 		 383 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.43 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.87 
 
 		 366 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.8 
 
 		 272 aa  49.7  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  32.1 
 
 		 580 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.29 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1921  hypothetical protein  27.05 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223609  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1667 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.37 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  37.04 
 
 		 556 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.29 
 
 		 810 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1410  PKD domain-containing protein  52.27 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.91 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3498  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.37 
 
 		 540 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>