17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0012 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0012  septum formation initiator  100 
 
 
110 aa  218  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07145  uridine kinase  50.47 
 
 
105 aa  103  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1161  hypothetical protein  38.71 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0699  Septum formation initiator  36.17 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.785798  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2004  Septum formation initiator  35.71 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3132  hypothetical protein  35.9 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.185544  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5031  hypothetical protein  36.67 
 
 
103 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1971  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4374  Septum formation initiator  31.11 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2688  Septum formation initiator  34.62 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49824  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0310  Septum formation initiator  32.43 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000820228  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0914  septum formation initiator  26.74 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000205593  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0187  Septum formation initiator  29.76 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0011  hypothetical protein  36.59 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0279  Septum formation initiator  25.56 
 
 
106 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.345769  hitchhiker  0.000225278 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1689  Septum formation initiator  28.17 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0348  hypothetical protein  25 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.690336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>