73 genes were found for organism Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ajs_4248  CDS  NC_008766  4  4746  +  4743  hypothetical protein  YP_974083  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4249  CDS  NC_008766  5044  5619  -  576  resolvase domain-containing protein  YP_974084  normal  1  normal  0.251845  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4250  CDS  NC_008766  5746  6051  -  306  addiction module antitoxin  YP_974085  normal  1  normal  0.0906167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4251  CDS  NC_008766  6137  6355  +  219  hypothetical protein  YP_974086  normal  1  normal  0.023425  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4252  CDS  NC_008766  6352  7308  +  957  DNA-cytosine methyltransferase  YP_974087  normal  1  normal  0.0263417  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4253  CDS  NC_008766  7308  8171  +  864  type II DNA restriction endonuclease R.NGOI  YP_974088  normal  1  normal  0.0257721  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4254  CDS  NC_008766  8338  8544  +  207  hypothetical protein  YP_974089  normal  1  normal  0.0216195  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4255  CDS  NC_008766  8608  8841  -  234  hypothetical protein  YP_974090  normal  1  normal  0.0221201  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4256    NC_008766  8856  9074  +  219      normal  1  normal  0.0223799  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4257  CDS  NC_008766  9010  9540  -  531  hypothetical protein  YP_974091  normal  1  normal  0.0251953  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4258  CDS  NC_008766  9619  10293  -  675  phage DNA methylase  YP_974092  normal  1  normal  0.0105966  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4259  CDS  NC_008766  10449  10880  -  432  hypothetical protein  YP_974093  normal  1  hitchhiker  0.00984605  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4260  CDS  NC_008766  10896  11594  -  699  conjugal transfer protein TrbP  YP_974094  normal  1  hitchhiker  0.00457278  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4261  CDS  NC_008766  11594  11860  -  267  hypothetical protein  YP_974095  normal  1  hitchhiker  0.00408343  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4262  CDS  NC_008766  11889  12524  -  636  conjugal transfer protein TrbN  YP_974096  normal  1  hitchhiker  0.00457278  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4263  CDS  NC_008766  12538  13122  -  585  conjugal transfer protein TrbM  YP_974097  normal  0.913263  hitchhiker  0.00445296  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4264  CDS  NC_008766  13139  14872  -  1734  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  YP_974098  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4265  CDS  NC_008766  14883  15110  -  228  entry exclusion protein TrbK  YP_974099  normal  0.0346234  decreased coverage  0.00151767  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4266  CDS  NC_008766  15120  15884  -  765  conjugal transfer protein TrbJ  YP_974100  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4267  CDS  NC_008766  15902  17320  -  1419  conjugal transfer protein TrbI  YP_974101  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4268  CDS  NC_008766  17325  17813  -  489  conjugal transfer protein TrbH  YP_974102  normal  0.121347  hitchhiker  0.00518099  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4269  CDS  NC_008766  17816  18715  -  900  conjugal transfer protein TrbG  YP_974103  normal  0.166546  normal  0.0145862  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4270  CDS  NC_008766  18733  19515  -  783  conjugal transfer protein TrbF  YP_974104  normal  0.117817  normal  0.0324718  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4271  CDS  NC_008766  19512  22070  -  2559  conjugal transfer protein TrbE  YP_974105  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4272  CDS  NC_008766  22067  22378  -  312  conjugal transfer protein TrbD  YP_974106  hitchhiker  0.000000000615182  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4273  CDS  NC_008766  22382  22846  -  465  conjugal transfer protein TrbC  YP_974107  hitchhiker  0.0000000000103754  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4274  CDS  NC_008766  22859  23824  -  966  conjugal transfer ATPase TrbB  YP_974108  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4275  CDS  NC_008766  24135  24497  -  363  conjugal transfer protein TrbA  YP_974109  decreased coverage  6.75879e-22  normal  0.733184  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4276  CDS  NC_008766  24606  24944  +  339  single-strand binding protein  YP_974110  hitchhiker  1.7148099999999997e-20  normal  0.751726  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4277  CDS  NC_008766  24992  26215  +  1224  TrfA family protein  YP_974111  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4278  CDS  NC_008766  26399  26614  -  216  hypothetical protein  YP_974112  hitchhiker  0.0000247953  normal  0.775083  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4279  CDS  NC_008766  26769  29168  +  2400  transposase Tn3 family protein  YP_974113  normal  0.0330145  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4280    NC_008766  29694  30483  -  790      normal  1  normal  0.921914  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4281  CDS  NC_008766  30539  30847  -  309  hypothetical protein  YP_974114  normal  1  normal  0.840631  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4282    NC_008766  31076  32206  -  1131      normal  1  normal  0.921914  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4283  CDS  NC_008766  32516  34096  +  1581  putative transposase  YP_974115  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4284  CDS  NC_008766  34349  35143  +  795  hydratase/decarboxylase  YP_974116  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4285  CDS  NC_008766  35214  35570  +  357  hypothetical protein  YP_974117  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4286    NC_008766  35550  35705  -  156      normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4287    NC_008766  35757  35858  -  102      normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4288  CDS  NC_008766  35859  38774  +  2916  transposase Tn3 family protein  YP_974118  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4289    NC_008766  38868  39113  +  246      normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4290  CDS  NC_008766  39194  40810  +  1617  putative transposase  YP_974119  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4291    NC_008766  40867  41616  +  750      normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4292  CDS  NC_008766  41801  42511  -  711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_974120  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4293    NC_008766  42692  43333  -  642      normal  0.0731453  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4294  CDS  NC_008766  43481  43969  +  489  hypothetical protein  YP_974121  hitchhiker  0.00377238  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4295    NC_008766  44211  44571  +  361      hitchhiker  0.0000235113  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4296  CDS  NC_008766  44596  44877  -  282  addiction module antitoxin  YP_974122  decreased coverage  0.0000000263758  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4297  CDS  NC_008766  44864  45127  -  264  addiction module antitoxin  YP_974123  decreased coverage  0.000000082937  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4298  CDS  NC_008766  45298  45729  +  432  antirestriction protein  YP_974124  hitchhiker  0.0000077834  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4299  CDS  NC_008766  45774  45992  +  219  hypothetical protein  YP_974125  hitchhiker  0.0000532586  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4300  CDS  NC_008766  46004  47206  +  1203  hypothetical protein  YP_974126  normal  0.0235978  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4301  CDS  NC_008766  47223  47480  +  258  hypothetical protein  YP_974127  normal  0.0106578  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4302  CDS  NC_008766  47637  47873  +  237  hypothetical protein  YP_974128  hitchhiker  0.00258642  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4303  CDS  NC_008766  48082  48408  +  327  hypothetical protein  YP_974129  hitchhiker  0.00464048  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4304  CDS  NC_008766  48411  48740  +  330  hypothetical protein  YP_974130  hitchhiker  0.00834367  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4305  CDS  NC_008766  48834  49916  +  1083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_974131  normal  0.0467548  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4306  CDS  NC_008766  49913  50980  +  1068  ParB family protein  YP_974132  normal  0.900798  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4307  CDS  NC_008766  51182  52189  +  1008  hypothetical protein  YP_974133  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4308  CDS  NC_008766  52360  52707  +  348  putative conjugation protein TraO  YP_974134  normal  0.992257  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4309  CDS  NC_008766  52737  53375  +  639  hypothetical protein  YP_974135  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4310  CDS  NC_008766  53571  54011  -  441  conjugal transfer protein TraM  YP_974136  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4311  CDS  NC_008766  54011  54736  -  726  conjugal transfer protein TraL  YP_974137  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4312  CDS  NC_008766  54736  55155  -  420  TraK protein of DNA transfer system  YP_974138  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4313  CDS  NC_008766  55518  55739  +  222  hypothetical protein  YP_974139  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4314  CDS  NC_008766  55744  56115  +  372  conjugal transfer relaxosome component TraJ  YP_974140  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4315  CDS  NC_008766  56150  58408  +  2259  conjugal transfer relaxase TraI  YP_974141  normal  0.599721  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4316  CDS  NC_008766  58405  58680  +  276  putative entry/exclusion protein TrbK  YP_974142  normal  0.183602  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4317  CDS  NC_008766  58677  60581  +  1905  conjugal transfer coupling protein TraG  YP_974143  normal  0.184857  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4318  CDS  NC_008766  60578  61114  +  537  conjugal transfer peptidase TraF  YP_974144  normal  0.666269  normal  0.975126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4319  CDS  NC_008766  61129  63192  +  2064  DNA topoisomerase III  YP_974145  normal  0.535821  normal  0.574882  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4320  CDS  NC_008766  63217  63609  +  393  conjugal transfer protein  YP_974146  normal  0.663774  normal  0.434763  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>