21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4277 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  79.85 
 
 		 406 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  100 
 
 		 407 aa  841    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  79.85 
 
 		 406 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  40.93 
 
 		 299 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  39.09 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  37.15 
 
 		 345 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  38.37 
 
 		 275 aa  160  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  38.37 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  34.58 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  34.14 
 
 		 285 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  33.2 
 
 		 285 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  28.62 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  26.5 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  25.69 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  26.48 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  25.98 
 
 		 325 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  28.63 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  25.17 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  25.88 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  31.1 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  23.23 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>