10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4260 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008766  Ajs_4260  conjugal transfer protein TrbP  100 
 
 		 232 aa  447  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457278 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6516  conjugal transfer protein TrbP  97.41 
 
 		 232 aa  417  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6621  conjugal transfer protein TrbP  97.41 
 
 		 232 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5825  conjugal transfer protein TrbP  49.52 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.516785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2132  conjugal transfer protein TrbP  39.44 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4312  TraX family protein  31.25 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.60113  decreased coverage  0.000185493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2245  TraX family protein  30.17 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0036166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0028  type-F conjugative transfer system pilin acetylase TraX  28.97 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.385557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05830  TraX domain-containing membrane protein  37.8 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2346  TraX family protein  26.07 
 
 		 225 aa  42  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>