18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2346 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2346  TraX family protein  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1445  hypothetical protein  32.33 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0480  TraX family protein  32.17 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3371  hypothetical protein  31.35 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000047546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2245  TraX family protein  28.32 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0036166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5825  conjugal transfer protein TrbP  24.43 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.516785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3013  TraX family protein  27.69 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5167  TraX family protein  28.02 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2699  TraX family protein  33.09 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2999  TraX family protein  26.05 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0028  type-F conjugative transfer system pilin acetylase TraX  26.15 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.385557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0411  hypothetical protein  34.55 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05830  TraX domain-containing membrane protein  36.25 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0030  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  24.83 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0080  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  24.83 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.391686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0272  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  24.83 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2132  conjugal transfer protein TrbP  27.27 
 
 		 214 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0924  hypothetical protein  40 
 
 		 274 aa  41.6  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0738773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>