14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_C0028 on replicon NC_009787
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009787  EcE24377A_C0028  type-F conjugative transfer system pilin acetylase TraX  100 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.385557  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0077  type-F conjugative transfer system pilin acetylase TraX, truncation  97.64 
 
 		 127 aa  201  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.835622  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0272  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  37.77 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0030  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  37.18 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0080  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  36.48 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.391686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0009  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  36.05 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000759662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0076  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  34.57 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.941243 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4312  TraX family protein  32.46 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.60113  decreased coverage  0.000185493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2132  conjugal transfer protein TrbP  44.12 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2346  TraX family protein  23.66 
 
 		 225 aa  52  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6516  conjugal transfer protein TrbP  30.77 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6621  conjugal transfer protein TrbP  30.77 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4260  conjugal transfer protein TrbP  28.85 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5825  conjugal transfer protein TrbP  29.2 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.516785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>