11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0030 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0030  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  100 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0272  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  97.03 
 
 		 248 aa  457  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0080  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  94.49 
 
 		 248 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.391686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0009  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  90.68 
 
 		 248 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000759662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0076  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  70.97 
 
 		 246 aa  338  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.941243 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0028  type-F conjugative transfer system pilin acetylase TraX  37.18 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.385557  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4312  TraX family protein  35.68 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.60113  decreased coverage  0.000185493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2132  conjugal transfer protein TrbP  39.36 
 
 		 214 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05830  TraX domain-containing membrane protein  36.92 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2346  TraX family protein  24.83 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2245  TraX family protein  41.67 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0036166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>