15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4312 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009425  Ent638_4312  TraX family protein  100 
 
 		 255 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.60113  decreased coverage  0.000185493 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0030  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  36.6 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0272  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  35.17 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0009  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  35.04 
 
 		 248 aa  92  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000759662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0080  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  35.47 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.391686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0076  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  34.62 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.941243 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0028  type-F conjugative transfer system pilin acetylase TraX  41.67 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.385557  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6516  conjugal transfer protein TrbP  31.54 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6621  conjugal transfer protein TrbP  31.54 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5825  conjugal transfer protein TrbP  34.06 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.516785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2132  conjugal transfer protein TrbP  36.17 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4260  conjugal transfer protein TrbP  31.25 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2699  TraX family protein  43.28 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05830  TraX domain-containing membrane protein  47.46 
 
 		 246 aa  45.4  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2245  TraX family protein  42.65 
 
 		 233 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0036166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>