15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2132 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2132  conjugal transfer protein TrbP  100 
 
 		 214 aa  415  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6516  conjugal transfer protein TrbP  38.97 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6621  conjugal transfer protein TrbP  38.97 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4260  conjugal transfer protein TrbP  39.44 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5825  conjugal transfer protein TrbP  35.32 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.516785  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0028  type-F conjugative transfer system pilin acetylase TraX  45.19 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.385557  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4312  TraX family protein  36.73 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.60113  decreased coverage  0.000185493 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0080  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  40.21 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.391686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0076  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  39.6 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.941243 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2346  TraX family protein  27.27 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0272  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  40.21 
 
 		 248 aa  52  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0030  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  40.59 
 
 		 248 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0009  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  36.08 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000759662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0480  TraX family protein  28.48 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2245  TraX family protein  26.41 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0036166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>