12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5825 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5825  conjugal transfer protein TrbP  100 
 
 		 238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.516785  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4260  conjugal transfer protein TrbP  49.52 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457278 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6516  conjugal transfer protein TrbP  48.1 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6621  conjugal transfer protein TrbP  48.1 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2132  conjugal transfer protein TrbP  35.32 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2346  TraX family protein  24.43 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4312  TraX family protein  34.06 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.60113  decreased coverage  0.000185493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2245  TraX family protein  30.58 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0036166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2699  TraX family protein  27 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0080  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  35.25 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.391686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0028  type-F conjugative transfer system pilin acetylase TraX  30.46 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.385557  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0076  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  40 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.941243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>