13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1445 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1445  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3371  hypothetical protein  38.52 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000047546  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2346  TraX family protein  36 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0480  TraX family protein  27.88 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1293  hypothetical protein  27.72 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3013  TraX family protein  26.07 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1507  hypothetical protein  26.89 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.347983  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2999  TraX family protein  22.56 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0924  hypothetical protein  34.94 
 
 		 274 aa  46.2  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0738773  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1982  hypothetical protein  26.69 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2245  TraX family protein  28.69 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0036166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0411  hypothetical protein  33.93 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5167  TraX family protein  31.53 
 
 		 243 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>