31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4315 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  84.75 
 
 		 746 aa  1232    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  45.95 
 
 		 830 aa  648    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  84.62 
 
 		 746 aa  1230    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  100 
 
 		 752 aa  1526    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  44.52 
 
 		 873 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  41.33 
 
 		 713 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  30.66 
 
 		 521 aa  211  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  34.64 
 
 		 650 aa  158  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  26.37 
 
 		 650 aa  138  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  26.37 
 
 		 651 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  25.86 
 
 		 805 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.24 
 
 		 659 aa  107  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3769  hypothetical protein  55.77 
 
 		 221 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330863  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  25.27 
 
 		 743 aa  100  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  27.2 
 
 		 899 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  26.82 
 
 		 899 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.64 
 
 		 843 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.09 
 
 		 303 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.17 
 
 		 635 aa  70.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  31 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0745  hypothetical protein  34.62 
 
 		 154 aa  57.4  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0072  hypothetical protein  23.56 
 
 		 657 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.59 
 
 		 281 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0329  hypothetical protein  43.33 
 
 		 623 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  24.82 
 
 		 398 aa  48.5  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.24 
 
 		 306 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0361  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.21 
 
 		 804 aa  46.2  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6701  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.14 
 
 		 440 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.201149 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08174  relaxase NikB  41.67 
 
 		 977 aa  45.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2839  hypothetical protein  23.88 
 
 		 208 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  23.44 
 
 		 307 aa  44.3  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>