76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4297 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  100 
 
 		 87 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  100 
 
 		 87 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  97.7 
 
 		 87 aa  166  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  77.65 
 
 		 87 aa  127  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  74.71 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  62.07 
 
 		 87 aa  116  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  64.37 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  61.25 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  54.02 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  55.17 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  51.19 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  51.19 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  51.76 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  53.57 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  48.28 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  50 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  47.25 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  49.4 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  55.88 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  55.88 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  55.88 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  55.88 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  55.88 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  55.88 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  55.88 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  55.88 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  54.41 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  54.41 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  64 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  47.13 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  63.27 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.7 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  54.55 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  38.55 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.55 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.55 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  60 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  65.31 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  45.33 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  62.5 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  43.21 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  47.62 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  32.88 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  42.03 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  32.18 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  37.21 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.92 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  29.63 
 
 		 84 aa  48.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  35.38 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  51.06 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  51.11 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  37.68 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0721  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.89 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  48.84 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.82 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  35.09 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4262  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.89 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2078  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.89 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200075  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  30.59 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.63 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.89 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  44.44 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2071  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.89 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.75 
 
 		 92 aa  42  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0017  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.89 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4396  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40 
 
 		 80 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.921307 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0548  putative RelB antitoxin  26.83 
 
 		 92 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4646  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40 
 
 		 80 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4468  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40 
 
 		 80 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.791173  normal  0.577271 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4331  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40 
 
 		 80 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  30.34 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.41 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1995  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  36.23 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  31.37 
 
 		 85 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>