70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1377 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  100 
 
 		 94 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  64.52 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.49 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  36.78 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  39.36 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.42 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  39.02 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  39.73 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  34.18 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  43.66 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.46 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.47 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  33.73 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  35.62 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  37.5 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  34.94 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.96 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.67 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  30.67 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  34.18 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40.68 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  36.9 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.47 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.53 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  32.88 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  32.88 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  37.66 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.71 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  32.5 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  32.5 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  32.5 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  32.5 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  31.4 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  32.5 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  32.5 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.46 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.5 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.88 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  35.14 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  34.67 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.76 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  32.5 
 
 		 86 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  29.79 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  31.43 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  34.48 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  42.31 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  28.92 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  28.92 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.46 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  35.19 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  33.33 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.18 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  33.33 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  35.48 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.84 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  37.25 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  36.73 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.04 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  38 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0721  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.79 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0239  RelB antitoxin family  39.13 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  41.67 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  39.13 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  36.96 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40 
 
 		 87 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  33.82 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  37.25 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  33.87 
 
 		 90 aa  40  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>