90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5830 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  100 
 
 		 98 aa  194  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  72.92 
 
 		 99 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  74.74 
 
 		 97 aa  144  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  74.74 
 
 		 99 aa  143  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  74.74 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  74.23 
 
 		 99 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  67.71 
 
 		 101 aa  130  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  60.98 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.76 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  55.56 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.76 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  54.88 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  48.81 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.32 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  54.17 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  50.98 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  54.17 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  49.02 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  50 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  49.02 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  49.02 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  49.02 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  49.02 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  49.02 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  49.02 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  49.02 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  50 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  47.37 
 
 		 60 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  47.17 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.92 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  48.65 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  47.92 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.92 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  47.17 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  47.92 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  47.92 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  56.82 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  45.83 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.92 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  43.75 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  38.89 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.59 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  43.9 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  43.9 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4715  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  38.89 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1147  hypothetical protein  44.74 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.348678 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  27.4 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2078  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.71 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  38.57 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0088475  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  44.68 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2071  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.71 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.71 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4262  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.71 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0017  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.71 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  27.27 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0194  hypothetical protein  48.72 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3527  hypothetical protein  39.58 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.268548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4829  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.29 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4700  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.29 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4850  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.29 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4795  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.29 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0434  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.29 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  57.69 
 
 		 152 aa  43.9  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  41.51 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  37.04 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  47.73 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.29 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  41.67 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.33 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  31.71 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  39.22 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  37.5 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1700  hypothetical protein  43.9 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1399  hypothetical protein  43.9 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.102306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00557  hypothetical protein  56.67 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  41.67 
 
 		 98 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5388  stability cassette protein, putative  39.71 
 
 		 79 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  35.29 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1047  DNA-damage-inducible protein J  39.58 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  43.9 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4468  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  33.82 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.791173  normal  0.577271 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4331  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  33.82 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4396  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  33.82 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.921307 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4646  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  33.82 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1757  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  38.55 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.85675 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  38.64 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0969  RelB protein  32.08 
 
 		 96 aa  40  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  33.33 
 
 		 104 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1183  RelB antitoxin  43.75 
 
 		 103 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.642171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1072  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  37.35 
 
 		 87 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.949266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>