71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4380 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  100 
 
 		 95 aa  186  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  94.25 
 
 		 87 aa  164  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  67.82 
 
 		 87 aa  123  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  63.22 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  62.07 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  62.07 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  71.43 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  55.81 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  51.72 
 
 		 87 aa  93.6  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  55.17 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  51.76 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  51.76 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  55.56 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  54.02 
 
 		 86 aa  84.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  50.59 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  45.98 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  47.67 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  50 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  50 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  50 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  50 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  50 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  50 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  50 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  51.47 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  46.99 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  55.56 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  55.56 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  50 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  50 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.68 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  52.38 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  45.33 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  40.23 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  60.42 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  54 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  33.73 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  47.62 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  57.78 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  32.94 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  57.14 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0721  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.16 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  35.44 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  49.06 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  43.55 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.92 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  37.35 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  28.74 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  42.25 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  39.47 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0088475  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  36.71 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1047  DNA-damage-inducible protein J  32.18 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  37.5 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  35.29 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  43.1 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  48.84 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  35.29 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  43.75 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4468  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  36.07 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.791173  normal  0.577271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  27.91 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.25 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4331  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  36.07 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4646  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  36.07 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4396  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  36.07 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.921307 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  38.78 
 
 		 84 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  48.84 
 
 		 99 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0548  putative RelB antitoxin  34.43 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1995  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  34.29 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0425  RelB antitoxin  40.98 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1236  DNA-damage-inducible protein J  40.98 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>