63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4999 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  100 
 
 		 99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  90.82 
 
 		 99 aa  179  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  81.82 
 
 		 99 aa  170  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  86.02 
 
 		 97 aa  165  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  74.74 
 
 		 98 aa  143  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  70.1 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  69.39 
 
 		 101 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  61.73 
 
 		 100 aa  104  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  60.76 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  57.69 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  57.69 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  56.41 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  52.56 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.71 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  54.35 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  60.47 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  55.56 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  51.02 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  55.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  48.98 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  55.56 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  41.67 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.25 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  51.11 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  51.11 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  51.11 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  47.92 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  50 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4715  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.21 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  50 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  50 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  50 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  50 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  50 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  50 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  47.22 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  50 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  51.28 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3527  hypothetical protein  45 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.268548  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  36.36 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  48.89 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1147  hypothetical protein  46.15 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.348678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  47.92 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00557  hypothetical protein  52.63 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  39.53 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1700  hypothetical protein  52.5 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1399  hypothetical protein  52.5 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.102306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  55 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  40.48 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  40.82 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4829  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.39 
 
 		 80 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4700  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.39 
 
 		 80 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4850  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.39 
 
 		 80 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  40 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4795  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.39 
 
 		 80 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  39.47 
 
 		 60 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.61 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  40.43 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.46 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0434  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.39 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1047  DNA-damage-inducible protein J  38.46 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>