82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3758 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  100 
 
 		 99 aa  203  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  81.82 
 
 		 99 aa  170  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  81.82 
 
 		 99 aa  167  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  77.42 
 
 		 97 aa  152  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  73.2 
 
 		 97 aa  148  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  72.92 
 
 		 98 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  64.29 
 
 		 101 aa  131  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  62.96 
 
 		 100 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  58.23 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  55.13 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  55.13 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  52.56 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  48.72 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.21 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  54.35 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  58.33 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  55.81 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  48.98 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  57.78 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  47.73 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  51.11 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  52.63 
 
 		 60 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1147  hypothetical protein  57.5 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.348678 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  46.94 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3527  hypothetical protein  45.83 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.268548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40.58 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  47.92 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  47.92 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  45.83 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  47.92 
 
 		 86 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  47.92 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.92 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  47.92 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  47.92 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  47.92 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  46.81 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  45.83 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4715  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.21 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  47.83 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  50 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.84 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  60 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00557  hypothetical protein  52.27 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  41.86 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  48.84 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  48.84 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1700  hypothetical protein  55 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1399  hypothetical protein  55 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.102306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  47.62 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  44 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.84 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  42.86 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1257  hypothetical protein  45.24 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482621  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4795  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.39 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4850  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.39 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4700  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.39 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4829  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.39 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  40.43 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  61.54 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  25 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  34.92 
 
 		 97 aa  42  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  60.71 
 
 		 146 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0434  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.39 
 
 		 80 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.74 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2071  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  34.29 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1072  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  41.1 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.949266  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2078  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.29 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200075  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  34.29 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4262  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  34.29 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1757  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  37.65 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.85675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.54 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4646  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.14 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  36.99 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0088475  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4396  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.14 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.921307 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4468  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.14 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.791173  normal  0.577271 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4331  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.14 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  56.67 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  41.67 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  31.34 
 
 		 92 aa  40.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  38.46 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0017  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  34.29 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.36 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>