51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1749 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  100 
 
 		 110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.76 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  38.55 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  38.55 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  37.93 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  39.29 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.33 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  38.2 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  46.67 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  38.75 
 
 		 86 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  40 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  40 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  38.75 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  40 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  40 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  40 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  41.54 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  37.5 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.77 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  35.63 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.63 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  36.9 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  36.59 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  29.89 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  39.66 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  32.99 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.33 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  38.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  46.15 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  39.71 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  39.39 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  44.23 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  37.29 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  34.07 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  34.48 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.92 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  37.74 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.73 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  31.87 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  33.87 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0265  DNA-damage-inducible protein J  41.79 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.58 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  29.87 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.46 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.26 
 
 		 95 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  33.93 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  38.3 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.14 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.33 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>