62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4999 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  100 
 
 		 86 aa  174  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  67.44 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  67.44 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  67.44 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  67.44 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  67.44 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  67.44 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  66.28 
 
 		 86 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  63.95 
 
 		 86 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  65.12 
 
 		 86 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  62.79 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  53.57 
 
 		 87 aa  84.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  56.52 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  50 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  50 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  53.62 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  53.62 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  43.53 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  52.94 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  45.35 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  45.71 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  54.69 
 
 		 63 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  50 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.02 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  50 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.69 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  47.69 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  42.05 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  53.97 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  46.67 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  53.45 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  62.5 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  33.33 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  56.86 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  56.86 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.72 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  33.73 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  42.65 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.9 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.9 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  55.77 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  47.17 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  51.85 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  57.45 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  55.32 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  56.25 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.17 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  57.78 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  55.56 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  46.77 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  36.51 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  25.93 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.63 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0357  DNA-damage-inducible protein J  34.57 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  29.89 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  36.96 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.73 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  32.93 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2510  RelB antitoxin  29.23 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.400211  normal  0.98229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  35.38 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  29.23 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0265  DNA-damage-inducible protein J  51.28 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>