60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2575 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  100 
 
 
95 aa  197  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  44.29 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  36.78 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  38.46 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  52.73 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  50.94 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  36.9 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.52 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  58.49 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  34.52 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  34.12 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.67 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  33.33 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  35.63 
 
 
89 aa  58.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  34.15 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  33.33 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.46 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.71 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.57 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  47.17 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0721  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.53 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  43.1 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00900  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.15 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  50.98 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.15 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  37.18 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  29.89 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  32.14 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.88 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  34.67 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.67 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  35.56 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  36.25 
 
 
85 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.13 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0548  putative RelB antitoxin  31.4 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  41.67 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  29.21 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  25 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  25.93 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  25 
 
 
86 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  25 
 
 
86 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  25 
 
 
86 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  25 
 
 
86 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  25 
 
 
86 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  25.93 
 
 
86 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.686864 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  25 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4839  addiction module antitoxin  33.87 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605483  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  26.19 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.89 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  26.19 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  35.21 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  35.29 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.18 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  28.09 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.84 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  32.14 
 
 
86 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  38.78 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>