41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0983 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  74.65 
 
 
91 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.62 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  41.98 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.62 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  47.62 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  47.62 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  39.44 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  48.39 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  46.77 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  45.16 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.55 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  43.21 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.71 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.1 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.68 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  39.68 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.67 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.88 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  35.21 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0222  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.67 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.654292  normal  0.738473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  35 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  50 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  40.62 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  38.71 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  31.65 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  37.1 
 
 
86 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  37.1 
 
 
86 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  37.1 
 
 
86 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  37.1 
 
 
86 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  37.1 
 
 
86 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  37.1 
 
 
86 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  37.1 
 
 
86 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  35.38 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  35.48 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.1 
 
 
86 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  47.5 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.65 
 
 
92 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  36.92 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  33.87 
 
 
94 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>