67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2863 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  100 
 
 		 87 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  60.24 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.31 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  42.5 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  48.78 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  53.33 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  47.56 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  47.56 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.56 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  53.33 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  40.74 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  48.28 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.28 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  46.91 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  44.58 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  42.53 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  58.33 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  41.11 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  48.44 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  38.57 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  50 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  43.02 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  35.8 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  50 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  35.8 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  40.23 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  37.04 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  37.04 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  37.35 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  37.04 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  37.04 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  37.04 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  37.04 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  37.04 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.04 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  41.46 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.17 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  43.02 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  36.9 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  52.27 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  47.27 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  41.54 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  35.71 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  36.9 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  50 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.71 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.63 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.62 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0721  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.91 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  31.03 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00900  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.21 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  32.93 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  36.17 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  43.48 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  29.76 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  40.98 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  42.22 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  38.78 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1477  RelB antitoxin  40.3 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.400201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.51 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.42 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  40.62 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.57 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  27.38 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  36.23 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40.91 
 
 		 89 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  33.33 
 
 		 104 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>