82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1496 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  100 
 
 
85 aa  173  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  43.02 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  41.86 
 
 
86 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  44.16 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  44.16 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  44.16 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  44.16 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  50 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  44.16 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  44.16 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.16 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  42.86 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  39.02 
 
 
86 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.03 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  37.18 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  43.9 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  53.33 
 
 
86 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  47.22 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  49.15 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  45.33 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  45.33 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  36 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.75 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  51.67 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  38.82 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  32 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40.24 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0721  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.12 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  40.24 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  35.71 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  42.31 
 
 
87 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  47.06 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.88 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.34 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  42.37 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  37.35 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  37.97 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0548  putative RelB antitoxin  36.47 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  33.73 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.63 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  33.33 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  46.94 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  44.44 
 
 
104 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  40.98 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  36.76 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.57 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4839  addiction module antitoxin  40.43 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605483  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  42.55 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  28.89 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  45.28 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.59 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  42.42 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.14 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  37.88 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0357  DNA-damage-inducible protein J  33.33 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.81 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00900  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40.38 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  31.25 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  45.1 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.23 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  32.18 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.13 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2510  RelB antitoxin  40 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.400211  normal  0.98229 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0365  RelB antitoxin  41.3 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.869677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2071  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.48 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  42.86 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.48 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4262  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.48 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0017  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.48 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2078  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.48 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200075  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  35.42 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  34.69 
 
 
84 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  47.06 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.84 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.84 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  39.58 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  42.86 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  28.99 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1236  DNA-damage-inducible protein J  33.87 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112561 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0425  RelB antitoxin  33.87 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  25.68 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  46.51 
 
 
97 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>