58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0379 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  100 
 
 		 64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  74.19 
 
 		 63 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  71.43 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  63.27 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  63.27 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  63.27 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  63.27 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  61.22 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  60.42 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  56 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  56 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  56 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  56 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  56 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  56 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  56 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  53.97 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  56 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  56.6 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  56.25 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  56 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  56.25 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  58.33 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  56 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.17 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  52.83 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  52.83 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  50 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  52.94 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  54.17 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  51.02 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  59.57 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  51.02 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  54.9 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  48.98 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  52.27 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  46.15 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  53.85 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  48.98 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  46.94 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.4 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  44 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  42.86 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  44.9 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  48.84 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.68 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  36 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  36.54 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  44.19 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  37.21 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  36.96 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  33.9 
 
 		 103 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1047  DNA-damage-inducible protein J  33.33 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  32.65 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  47.5 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.86 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  32.69 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.3 
 
 		 101 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>