73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2090 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  100 
 
 
98 aa  194  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  67.01 
 
 
100 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  68.6 
 
 
102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  68.6 
 
 
102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  60.82 
 
 
102 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  66.28 
 
 
101 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  60.76 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  58.23 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.88 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  56.1 
 
 
97 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  59.49 
 
 
99 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  46.32 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  50.63 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  65.31 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  65.31 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  65.31 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  59.18 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  61.22 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  59.18 
 
 
63 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  59.18 
 
 
87 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  53.85 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  53.85 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  55.77 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  57.14 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  59.57 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  55.1 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  52 
 
 
89 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  52 
 
 
89 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  52.83 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  52.83 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  52.83 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  52.83 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  52.83 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  52.83 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  52.83 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  52.83 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  50.98 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  48.98 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  53.06 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  43.28 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  44.9 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.44 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  31.17 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  47.92 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  46.94 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4468  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  41.1 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.791173  normal  0.577271 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4331  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  41.1 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4646  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  41.1 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4396  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  41.1 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.921307 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.18 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  31.08 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  42.86 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0088475  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  53.85 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  53.85 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  48.08 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  39.13 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  47.62 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  29.76 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.33 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0017  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  44.23 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4715  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.62 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2071  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  44.23 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4262  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  44.23 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  44.23 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  41.46 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  27.91 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2078  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.23 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1995  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  46.51 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  40.43 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.49 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  31.03 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  39.02 
 
 
75 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>