24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0821 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5983  hypothetical protein  63.43 
 
 		 153 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7133  hypothetical protein  61.76 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  59.85 
 
 		 152 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4957  hypothetical protein  52.82 
 
 		 147 aa  159  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878072  hitchhiker  0.000117069 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  52.82 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  54.93 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  54.93 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0139  hypothetical protein  54.93 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4990  hypothetical protein  48.85 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3568  hypothetical protein  46.08 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.811641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  40.38 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  40.38 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  40.38 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  75.56 
 
 		 49 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0040  hypothetical protein  30.77 
 
 		 92 aa  50.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0861806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  53.66 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  54.55 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  65.52 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  47.62 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  55.17 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  60.71 
 
 		 99 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3473  hypothetical protein  47.5 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.9 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>